Profilage des cellules immunitaires des patients COVID-19 en phase de récupération par séquençage unicellulaire

Hussin A. Rothana, Siddappa N. Byrareddy

Profilage des cellules immunitaires des patients COVID-19 en phase de récupération par séquençage unicellulaire

Wen Wen, Wenru Su, Hao Tang, Wenqing Le, Xiaopeng Zhang, Yingfeng Zheng, Xiuxing Liu, Lihui Xie, Jianmin Li, Jinguo Ye, Liwei Dong, Xiuliang Cui1, Yushan Miao, Depeng Wang, Jiantao Dong, Chuanle Xiao, Wei Chen et Hongyang Wang

Cellule découverte. 2020;6:31. Publié le 2020 mai 4. doi:10.1038/s41421-020-0168-9

RÉSUMÉ

Le COVID-19, causé par le SRAS-CoV-2, a récemment touché plus de 1.200,000 60.000 XNUMX personnes et en a tué plus de XNUMX XNUMX.
Les principaux sous-ensembles de cellules immunitaires changent et leurs états au cours de la COVID-19 restent flous.
Nous avons tenté de caractériser de manière exhaustive les changements transcriptionnels dans les cellules mononucléaires du sang périphérique au cours de la phase de récupération de COVID-19 en utilisant la technique de séquençage d'ARN unicellulaire :

  • Les lymphocytes T se sont avérés nettement diminués tandis que les monocytes étaient augmentés chez les patients au stade de récupération précoce (ERT) de COVID-19.
  • Il y avait une proportion plus élevée de monocytes CD14++ classiques avec une expression élevée de gènes inflammatoires, ainsi qu'une plus grande abondance de monocytes IL1β+ CD14++ dans l'ERT.
  • Les lymphocytes T CD4+ et les lymphocytes T CD8+ étaient significativement régulés à la baisse et exprimaient des niveaux élevés de gènes inflammatoires dans le SRE.
  • Parmi les lymphocytes B, les plasmocytes ont été nettement augmentés, tandis que les lymphocytes B naïfs ont diminué.
  • Plusieurs nouvelles modifications du récepteur des cellules B (BCR) ont été identifiées, telles que IGHV3-23 et IGHV3-7, et les isotypes (IGHV3-15, IGHV3-30 et IGKV3-11) précédemment utilisés pour le développement de vaccins ont été confirmés. :
    • Les fréquences d'appariement les plus fortes, IGHV3-23-IGHJ4, indiquaient un état monoclonal associé à la spécificité du SRAS-CoV-2, qui n'avait pas encore été signalée.
  • De plus, l'analyse intégrée a prédit que l'IL-1β et le M-CSF pourraient être de nouveaux gènes cibles candidats pour les états inflammatoires et que le TNFSF13, l'IL-18, l'IL-2 et l'IL-4 pourraient être bénéfiques pour le rétablissement des patients COVID-19. .

Notre étude fournit la première preuve d'un état immunitaire inflammatoire en ERT, suggérant que les patients atteints de COVID-19 restent vulnérables après leur sortie de l'hôpital. L'identification de nouveaux signaux BCR pourrait conduire au développement de vaccins et d'anticorps pour le traitement du COVID-19.